Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATMQ13315 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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