Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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