Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms