Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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