Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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