Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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