Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHD3Q12873 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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