Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.4 ms