Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPRMP28827 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPRMP28827 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPRMP28827 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRMP28827 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRMP28827 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PTPRMP28827 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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