Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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