Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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RBM42Q9BTD8 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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RBM42Q9BTD8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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RBM42Q9BTD8 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RBM42Q9BTD8 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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