Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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