Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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TRERF1Q96PN7 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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TRERF1Q96PN7 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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TRERF1Q96PN7 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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