Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms