Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms