Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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