Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SSX1Q16384 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SSX1Q16384 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SSX1Q16384 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SSX1Q16384 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SSX1Q16384 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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