Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms