Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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