Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms