Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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