Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms