Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTTNQ14247 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms