Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CDK13Q14004 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms