Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
APOFQ13790 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
APOFQ13790 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
APOFQ13790 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
APOFQ13790 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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APOFQ13790 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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APOFQ13790 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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APOFQ13790 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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APOFQ13790 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
APOFQ13790 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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APOFQ13790 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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APOFQ13790 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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