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| RUNX3 | Q13761 | AC004801.2-202 | ENST00000463559 | 283 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002884.2-201 | ENST00000471647 | 395 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27AP1-201 | ENST00000475545 | 471 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02173-201 | ENST00000504132 | 521 nt | TSL 2 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010486.1-201 | ENST00000511793 | 424 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093766.1-202 | ENST00000513400 | 718 nt | TSL 3 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL359693.1-201 | ENST00000614959 | 2407 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRP72P2-201 | ENST00000344851 | 1979 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDST3-201 | ENST00000296499 | 5961 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01021-204 | ENST00000512067 | 1610 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OXR1-207 | ENST00000497705 | 2007 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VIM-AS1-201 | ENST00000437232 | 1351 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MARCH7-202 | ENST00000409175 | 2402 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.77-201 | ENST00000362962 | 107 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU5F-6P-201 | ENST00000362979 | 116 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.4-201 | ENST00000363352 | 213 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.436-201 | ENST00000384097 | 102 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.548-201 | ENST00000384656 | 105 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z99497.1-201 | ENST00000421282 | 135 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244098.2-201 | ENST00000422068 | 99 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP46-201 | ENST00000423569 | 204 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL096799.1-201 | ENST00000425900 | 381 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591475.1-201 | ENST00000429060 | 489 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL365184.2-201 | ENST00000431139 | 435 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092839.1-201 | ENST00000433475 | 536 nt | TSL 4 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512286.1-201 | ENST00000439244 | 400 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01474-202 | ENST00000449235 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLSCR5-AS1-201 | ENST00000473817 | 450 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092608.1-201 | ENST00000503505 | 267 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010625.1-201 | ENST00000511296 | 403 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114781.4-201 | ENST00000513707 | 639 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC017037.2-201 | ENST00000513850 | 890 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRTM2-203 | ENST00000521094 | 1182 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090539.1-201 | ENST00000523907 | 434 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027018.1-201 | ENST00000533978 | 396 nt | TSL 4 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087260.1-201 | ENST00000546118 | 401 nt | TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC123905.1-201 | ENST00000552098 | 541 nt | TSL 4 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157955.1-201 | ENST00000554433 | 331 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM87A-212 | ENST00000568432 | 750 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AP001004.1-201 | ENST00000582468 | 324 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL26-207 | ENST00000583011 | 524 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR548AB-201 | ENST00000584917 | 84 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBR2-204 | ENST00000587322 | 63 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024563.1-202 | ENST00000597533 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090186.1-201 | ENST00000605991 | 572 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158063.1-201 | ENST00000615349 | 536 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL596245.1-201 | ENST00000618994 | 362 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244517.5-202 | ENST00000623741 | 500 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390237.1-201 | ENST00000404226 | 1415 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGPD3-202 | ENST00000409886 | 5594 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF2A-201 | ENST00000273435 | 2083 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HELZ-201 | ENST00000358691 | 13810 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR9-1-201 | ENST00000385198 | 89 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS3AP26-201 | ENST00000398259 | 784 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC126-203 | ENST00000410069 | 890 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP266-201 | ENST00000410232 | 287 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAGI2-AS2-201 | ENST00000411616 | 476 nt | TSL 2 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS15AP38-201 | ENST00000413110 | 372 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX41-204 | ENST00000423031 | 491 nt | TSL 4 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND1P30-201 | ENST00000441241 | 901 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01317-202 | ENST00000442026 | 677 nt | TSL 3 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01828-202 | ENST00000450294 | 955 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL36AP33-201 | ENST00000450395 | 310 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC126389.1-201 | ENST00000477436 | 290 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDCD10-214 | ENST00000487947 | 716 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023424.2-201 | ENST00000493479 | 777 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092104.1-201 | ENST00000497346 | 1441 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC078918.1-201 | ENST00000498515 | 228 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024589.1-201 | ENST00000512207 | 263 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022447.1-201 | ENST00000515358 | 464 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090796.1-201 | ENST00000520370 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090857.2-201 | ENST00000526362 | 723 nt | TSL 2 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108471.2-204 | ENST00000526807 | 784 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090092.1-201 | ENST00000530576 | 510 nt | TSL 2 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013828.2-201 | ENST00000532487 | 235 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133166.1-201 | ENST00000551040 | 1034 nt | TSL 4 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |