Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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