Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRR1Q13601 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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