Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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