Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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MKRN4PQ13434 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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