Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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TCOF1Q13428 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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TCOF1Q13428 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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TCOF1Q13428 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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TCOF1Q13428 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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TCOF1Q13428 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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