Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms