Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SP140Q13342 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SP140Q13342 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SP140Q13342 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SP140Q13342 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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