Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms