Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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