Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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IFT88Q13099 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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IFT88Q13099 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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IFT88Q13099 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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IFT88Q13099 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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