Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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