Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms