Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSTF3Q12996 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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