Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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