Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP35Q9P2H5 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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