Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms