Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms