Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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