Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC9Q96Q05 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms