Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGGTAQ92696 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms