Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP53Q70EK8 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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