Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms