Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD39Q53RE8 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD39Q53RE8 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD39Q53RE8 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD39Q53RE8 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD39Q53RE8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
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