Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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