Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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